Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CPS1P31327 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CPS1P31327 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CPS1P31327 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CPS1P31327 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CPS1P31327 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CPS1P31327 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CPS1P31327 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CPS1P31327 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CPS1P31327 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CPS1P31327 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CPS1P31327 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CPS1P31327 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CPS1P31327 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CPS1P31327 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CPS1P31327 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CPS1P31327 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CPS1P31327 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CPS1P31327 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CPS1P31327 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CPS1P31327 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CPS1P31327 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CPS1P31327 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CPS1P31327 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CPS1P31327 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CPS1P31327 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CPS1P31327 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CPS1P31327 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CPS1P31327 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CPS1P31327 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CPS1P31327 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CPS1P31327 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CPS1P31327 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CPS1P31327 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CPS1P31327 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CPS1P31327 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CPS1P31327 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CPS1P31327 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CPS1P31327 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CPS1P31327 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CPS1P31327 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CPS1P31327 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CPS1P31327 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CPS1P31327 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CPS1P31327 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CPS1P31327 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CPS1P31327 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CPS1P31327 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CPS1P31327 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CPS1P31327 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CPS1P31327 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CPS1P31327 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CPS1P31327 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CPS1P31327 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CPS1P31327 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CPS1P31327 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CPS1P31327 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CPS1P31327 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CPS1P31327 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CPS1P31327 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CPS1P31327 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CPS1P31327 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CPS1P31327 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CPS1P31327 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CPS1P31327 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CPS1P31327 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CPS1P31327 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CPS1P31327 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CPS1P31327 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CPS1P31327 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CPS1P31327 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CPS1P31327 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CPS1P31327 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CPS1P31327 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CPS1P31327 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CPS1P31327 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CPS1P31327 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CPS1P31327 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CPS1P31327 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CPS1P31327 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CPS1P31327 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CPS1P31327 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CPS1P31327 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CPS1P31327 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CPS1P31327 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CPS1P31327 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CPS1P31327 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
CPS1P31327 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CPS1P31327 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.83
CPS1P31327 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CPS1P31327 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CPS1P31327 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CPS1P31327 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CPS1P31327 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CPS1P31327 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CPS1P31327 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CPS1P31327 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CPS1P31327 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CPS1P31327 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CPS1P31327 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms