Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa10P31310 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa10P31310 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa10P31310 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa10P31310 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa10P31310 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa10P31310 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa10P31310 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxa10P31310 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa10P31310 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms