Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxc10P31257 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc10P31257 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc10P31257 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxc10P31257 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxc10P31257 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxc10P31257 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxc10P31257 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hoxc10P31257 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxc10P31257 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc10P31257 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxc10P31257 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc10P31257 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxc10P31257 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxc10P31257 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc10P31257 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxc10P31257 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc10P31257 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc10P31257 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc10P31257 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxc10P31257 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc10P31257 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc10P31257 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc10P31257 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxc10P31257 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hoxc10P31257 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxc10P31257 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxc10P31257 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc10P31257 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxc10P31257 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxc10P31257 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc10P31257 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc10P31257 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc10P31257 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxc10P31257 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxc10P31257 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc10P31257 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms