Protein–RNA interactions for Protein: P30988

CALCR, Calcitonin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRP30988 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCRP30988 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCRP30988 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCRP30988 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCRP30988 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALCRP30988 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALCRP30988 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALCRP30988 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALCRP30988 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCRP30988 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALCRP30988 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCRP30988 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCRP30988 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCRP30988 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCRP30988 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCRP30988 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCRP30988 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCRP30988 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCRP30988 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCRP30988 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCRP30988 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCRP30988 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCRP30988 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCRP30988 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCRP30988 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCRP30988 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCRP30988 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCRP30988 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCRP30988 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCRP30988 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCRP30988 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALCRP30988 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCRP30988 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCRP30988 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCRP30988 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCRP30988 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCRP30988 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCRP30988 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCRP30988 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCRP30988 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCRP30988 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCRP30988 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCRP30988 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCRP30988 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCRP30988 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCRP30988 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCRP30988 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCRP30988 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCRP30988 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCRP30988 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCRP30988 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCRP30988 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCRP30988 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCRP30988 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCRP30988 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCRP30988 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCRP30988 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCRP30988 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCRP30988 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCRP30988 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCRP30988 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCRP30988 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCRP30988 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCRP30988 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCRP30988 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCRP30988 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCRP30988 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCRP30988 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCRP30988 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCRP30988 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCRP30988 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCRP30988 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCRP30988 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCRP30988 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCRP30988 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCRP30988 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCRP30988 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCRP30988 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCRP30988 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCRP30988 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCRP30988 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCRP30988 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCRP30988 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCRP30988 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALCRP30988 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALCRP30988 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCRP30988 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCRP30988 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALCRP30988 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCRP30988 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALCRP30988 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCRP30988 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALCRP30988 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALCRP30988 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCRP30988 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCRP30988 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCRP30988 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCRP30988 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALCRP30988 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALCRP30988 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms