Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tacr2P30549 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tacr2P30549 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tacr2P30549 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tacr2P30549 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tacr2P30549 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tacr2P30549 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tacr2P30549 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tacr2P30549 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tacr2P30549 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tacr2P30549 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tacr2P30549 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tacr2P30549 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tacr2P30549 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tacr2P30549 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tacr2P30549 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tacr2P30549 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tacr2P30549 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tacr2P30549 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tacr2P30549 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tacr2P30549 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms