Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDC27P30260 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDC27P30260 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDC27P30260 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDC27P30260 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDC27P30260 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDC27P30260 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDC27P30260 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDC27P30260 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CDC27P30260 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDC27P30260 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDC27P30260 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDC27P30260 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDC27P30260 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDC27P30260 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDC27P30260 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDC27P30260 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDC27P30260 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDC27P30260 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDC27P30260 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDC27P30260 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDC27P30260 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDC27P30260 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CDC27P30260 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CDC27P30260 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDC27P30260 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDC27P30260 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDC27P30260 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDC27P30260 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDC27P30260 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDC27P30260 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDC27P30260 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDC27P30260 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDC27P30260 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDC27P30260 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CDC27P30260 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDC27P30260 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDC27P30260 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CDC27P30260 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDC27P30260 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDC27P30260 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDC27P30260 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDC27P30260 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDC27P30260 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDC27P30260 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDC27P30260 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDC27P30260 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDC27P30260 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CDC27P30260 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
CDC27P30260 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDC27P30260 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDC27P30260 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDC27P30260 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDC27P30260 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDC27P30260 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDC27P30260 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDC27P30260 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDC27P30260 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDC27P30260 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDC27P30260 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDC27P30260 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDC27P30260 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDC27P30260 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDC27P30260 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDC27P30260 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDC27P30260 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDC27P30260 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDC27P30260 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDC27P30260 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDC27P30260 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CDC27P30260 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CDC27P30260 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDC27P30260 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CDC27P30260 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDC27P30260 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDC27P30260 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDC27P30260 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CDC27P30260 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDC27P30260 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDC27P30260 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDC27P30260 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDC27P30260 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDC27P30260 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDC27P30260 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDC27P30260 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDC27P30260 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDC27P30260 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDC27P30260 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDC27P30260 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDC27P30260 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDC27P30260 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDC27P30260 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDC27P30260 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDC27P30260 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDC27P30260 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDC27P30260 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDC27P30260 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDC27P30260 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDC27P30260 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDC27P30260 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms