Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDX6P30041 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDX6P30041 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDX6P30041 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDX6P30041 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDX6P30041 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDX6P30041 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDX6P30041 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDX6P30041 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDX6P30041 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDX6P30041 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDX6P30041 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDX6P30041 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDX6P30041 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms