Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HTR1EP28566 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HTR1EP28566 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR1EP28566 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR1EP28566 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR1EP28566 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTR1EP28566 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR1EP28566 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1EP28566 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1EP28566 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR1EP28566 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR1EP28566 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR1EP28566 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR1EP28566 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTR1EP28566 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HTR1EP28566 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms