Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHATP28329 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHATP28329 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHATP28329 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHATP28329 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHATP28329 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHATP28329 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHATP28329 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHATP28329 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHATP28329 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHATP28329 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHATP28329 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHATP28329 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHATP28329 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHATP28329 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHATP28329 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHATP28329 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHATP28329 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHATP28329 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHATP28329 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHATP28329 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHATP28329 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHATP28329 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHATP28329 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHATP28329 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHATP28329 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHATP28329 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHATP28329 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHATP28329 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHATP28329 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHATP28329 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHATP28329 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHATP28329 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHATP28329 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHATP28329 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHATP28329 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHATP28329 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHATP28329 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHATP28329 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHATP28329 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHATP28329 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHATP28329 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHATP28329 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHATP28329 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHATP28329 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHATP28329 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHATP28329 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHATP28329 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHATP28329 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHATP28329 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHATP28329 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHATP28329 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHATP28329 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHATP28329 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHATP28329 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHATP28329 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHATP28329 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHATP28329 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHATP28329 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHATP28329 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHATP28329 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHATP28329 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHATP28329 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHATP28329 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHATP28329 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHATP28329 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHATP28329 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHATP28329 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHATP28329 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHATP28329 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHATP28329 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHATP28329 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHATP28329 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHATP28329 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHATP28329 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHATP28329 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHATP28329 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHATP28329 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHATP28329 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHATP28329 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHATP28329 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHATP28329 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHATP28329 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHATP28329 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHATP28329 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHATP28329 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHATP28329 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHATP28329 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHATP28329 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHATP28329 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHATP28329 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHATP28329 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHATP28329 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHATP28329 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHATP28329 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHATP28329 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHATP28329 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHATP28329 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHATP28329 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHATP28329 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms