Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMOD1P28289 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMOD1P28289 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD1P28289 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD1P28289 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD1P28289 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD1P28289 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD1P28289 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD1P28289 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD1P28289 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms