Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-DMaP28078 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-DMaP28078 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-DMaP28078 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-DMaP28078 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-DMaP28078 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-DMaP28078 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-DMaP28078 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-DMaP28078 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-DMaP28078 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-DMaP28078 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-DMaP28078 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-DMaP28078 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-DMaP28078 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-DMaP28078 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-DMaP28078 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-DMaP28078 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-DMaP28078 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-DMaP28078 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-DMaP28078 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-DMaP28078 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-DMaP28078 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-DMaP28078 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-DMaP28078 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-DMaP28078 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms