Protein–RNA interactions for Protein: P27539

GDF1, Embryonic growth/differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF1P27539 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF1P27539 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF1P27539 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF1P27539 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF1P27539 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF1P27539 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF1P27539 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF1P27539 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF1P27539 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF1P27539 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GDF1P27539 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF1P27539 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF1P27539 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF1P27539 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF1P27539 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF1P27539 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF1P27539 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF1P27539 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF1P27539 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF1P27539 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF1P27539 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF1P27539 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF1P27539 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF1P27539 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF1P27539 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF1P27539 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF1P27539 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF1P27539 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF1P27539 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF1P27539 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF1P27539 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF1P27539 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF1P27539 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF1P27539 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF1P27539 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF1P27539 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF1P27539 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF1P27539 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF1P27539 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF1P27539 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF1P27539 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF1P27539 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF1P27539 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF1P27539 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF1P27539 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF1P27539 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF1P27539 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF1P27539 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF1P27539 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF1P27539 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF1P27539 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF1P27539 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF1P27539 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF1P27539 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF1P27539 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF1P27539 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF1P27539 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF1P27539 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF1P27539 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF1P27539 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF1P27539 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF1P27539 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF1P27539 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF1P27539 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF1P27539 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF1P27539 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF1P27539 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF1P27539 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF1P27539 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF1P27539 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF1P27539 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF1P27539 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF1P27539 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF1P27539 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF1P27539 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF1P27539 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF1P27539 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF1P27539 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF1P27539 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF1P27539 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF1P27539 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDF1P27539 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDF1P27539 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDF1P27539 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF1P27539 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF1P27539 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF1P27539 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDF1P27539 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF1P27539 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF1P27539 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDF1P27539 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF1P27539 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF1P27539 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF1P27539 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF1P27539 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF1P27539 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF1P27539 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF1P27539 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF1P27539 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF1P27539 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms