Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIFP27352 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIFP27352 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIFP27352 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIFP27352 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIFP27352 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIFP27352 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIFP27352 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIFP27352 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIFP27352 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIFP27352 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIFP27352 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIFP27352 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIFP27352 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIFP27352 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GIFP27352 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIFP27352 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIFP27352 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIFP27352 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIFP27352 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIFP27352 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GIFP27352 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIFP27352 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GIFP27352 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIFP27352 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIFP27352 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIFP27352 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIFP27352 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIFP27352 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIFP27352 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIFP27352 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIFP27352 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIFP27352 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIFP27352 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIFP27352 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIFP27352 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIFP27352 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIFP27352 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIFP27352 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIFP27352 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIFP27352 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIFP27352 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GIFP27352 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIFP27352 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIFP27352 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIFP27352 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIFP27352 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIFP27352 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIFP27352 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIFP27352 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIFP27352 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIFP27352 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIFP27352 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIFP27352 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIFP27352 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIFP27352 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GIFP27352 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIFP27352 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIFP27352 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIFP27352 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIFP27352 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIFP27352 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIFP27352 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIFP27352 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIFP27352 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIFP27352 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIFP27352 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIFP27352 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIFP27352 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIFP27352 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GIFP27352 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIFP27352 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIFP27352 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIFP27352 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GIFP27352 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIFP27352 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GIFP27352 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIFP27352 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIFP27352 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIFP27352 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIFP27352 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIFP27352 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIFP27352 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIFP27352 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIFP27352 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIFP27352 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIFP27352 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIFP27352 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIFP27352 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIFP27352 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIFP27352 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIFP27352 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIFP27352 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIFP27352 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIFP27352 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIFP27352 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIFP27352 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIFP27352 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms