Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms