Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL3RAP26951 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3RAP26951 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL3RAP26951 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL3RAP26951 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3RAP26951 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3RAP26951 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IL3RAP26951 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IL3RAP26951 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3RAP26951 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms