Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PdgfraP26618 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdgfraP26618 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdgfraP26618 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PdgfraP26618 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdgfraP26618 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdgfraP26618 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdgfraP26618 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PdgfraP26618 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PdgfraP26618 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PdgfraP26618 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PdgfraP26618 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PdgfraP26618 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PdgfraP26618 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdgfraP26618 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdgfraP26618 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdgfraP26618 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PdgfraP26618 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdgfraP26618 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PdgfraP26618 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfraP26618 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdgfraP26618 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfraP26618 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfraP26618 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdgfraP26618 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms