Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.253e-13■■■■■ 65.6
DDX6P26196 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.273e-13■■■■■ 65.6
DDX6P26196 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-13■■■■■ 65.6
DDX6P26196 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.33e-13■■■■■ 65.6
DDX6P26196 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-13■■■■■ 65.6
DDX6P26196 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 65.5
DDX6P26196 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.722e-12■■■■■ 65.5
DDX6P26196 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 64.9
DDX6P26196 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 64.9
DDX6P26196 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 64.9
DDX6P26196 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 64.9
DDX6P26196 PACS2-207ENST00000548265 402 ntTSL 216.08■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 64.9
DDX6P26196 PACS2-204ENST00000546915 576 ntTSL 415.86■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 64.9
DDX6P26196 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 64.7
DDX6P26196 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 64.7
DDX6P26196 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 64.7
DDX6P26196 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 513.02□□□□□ -0.337e-9■■■■■ 64.7
DDX6P26196 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 57.03□□□□□ -1.287e-9■■■■■ 64.7
DDX6P26196 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.97■■□□□ 1.279e-8■■■■■ 64.3
DDX6P26196 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.3■□□□□ 0.29e-8■■■■■ 64.3
DDX6P26196 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.766e-8■■■■■ 63.6
DDX6P26196 ISCU-207ENST00000539580 1169 ntTSL 1 (best)19.82■□□□□ 0.766e-8■■■■■ 63.6
DDX6P26196 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.76e-8■■■■■ 63.6
DDX6P26196 ISCU-211ENST00000545932 3685 ntTSL 212.57□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 63.6
DDX6P26196 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-15■■■■■ 63.3
DDX6P26196 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 62.2
DDX6P26196 TELO2-207ENST00000568240 1327 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.381e-10■■■■■ 61.8
DDX6P26196 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 61.8
DDX6P26196 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 61.7
DDX6P26196 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.11e-7■■■■■ 60.9
DDX6P26196 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.21■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 60.9
DDX6P26196 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 60.9
DDX6P26196 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 60.9
DDX6P26196 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 519.31■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 60.9
DDX6P26196 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 326.8■■□□□ 1.881e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-208ENST00000469356 1323 ntTSL 324.16■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-210ENST00000471445 936 ntTSL 222.4■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 221.72■■□□□ 1.071e-21■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 520.69■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 ALOX12P2-209ENST00000574271 984 ntTSL 320.58■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-214ENST00000595722 1826 ntTSL 1 (best)20.4■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 519.02■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 ALOX12P2-201ENST00000570835 598 ntTSL 418.58■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-11■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 418.21■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 217.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-219ENST00000580540 540 ntTSL 417.7■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-221ENST00000583080 482 ntTSL 517.42■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 416.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 NUP210-204ENST00000485755 474 ntTSL 515.97■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 215.61■□□□□ 0.097e-10■■■■■ 60
DDX6P26196 ALOX12P2-212ENST00000576636 574 ntTSL 415.5■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.77□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-18■■■■■ 60
DDX6P26196 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CERS4-207ENST00000558877 758 ntTSL 314.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 TRAF2-202ENST00000414589 680 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-14■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.217e-10■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SMAD7-202ENST00000545051 2211 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-215ENST00000487401 477 ntTSL 213.36□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.287e-10■■■■■ 60
DDX6P26196 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.527e-10■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.537e-10■■■■■ 60
DDX6P26196 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-216ENST00000524481 3157 ntTSL 211.52□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 210.86□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 UBD-203ENST00000377050 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 510.25□□□□□ -0.777e-10■■■■■ 60
DDX6P26196 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 60
DDX6P26196 CEP192-208ENST00000510237 6548 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 60
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 191.6 ms