Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL8A2P25067 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL8A2P25067 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL8A2P25067 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL8A2P25067 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL8A2P25067 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL8A2P25067 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms