Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GADD45AP24522 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GADD45AP24522 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GADD45AP24522 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GADD45AP24522 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GADD45AP24522 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GADD45AP24522 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GADD45AP24522 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GADD45AP24522 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45AP24522 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45AP24522 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45AP24522 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45AP24522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45AP24522 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45AP24522 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45AP24522 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GADD45AP24522 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms