Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDELR1P24390 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDELR1P24390 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDELR1P24390 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDELR1P24390 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDELR1P24390 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDELR1P24390 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDELR1P24390 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDELR1P24390 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDELR1P24390 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDELR1P24390 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDELR1P24390 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDELR1P24390 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDELR1P24390 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDELR1P24390 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDELR1P24390 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDELR1P24390 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDELR1P24390 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDELR1P24390 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDELR1P24390 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDELR1P24390 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDELR1P24390 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms