Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxd11P23813 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxd11P23813 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hoxd11P23813 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hoxd11P23813 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Hoxd11P23813 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Hoxd11P23813 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Hoxd11P23813 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hoxd11P23813 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hoxd11P23813 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hoxd11P23813 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Hoxd11P23813 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hoxd11P23813 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hoxd11P23813 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hoxd11P23813 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hoxd11P23813 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hoxd11P23813 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hoxd11P23813 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hoxd11P23813 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hoxd11P23813 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hoxd11P23813 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hoxd11P23813 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hoxd11P23813 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hoxd11P23813 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hoxd11P23813 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hoxd11P23813 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hoxd11P23813 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hoxd11P23813 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Hoxd11P23813 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hoxd11P23813 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hoxd11P23813 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxd11P23813 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
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