Protein–RNA interactions for Protein: P23771

GATA3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA3P23771 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA3P23771 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA3P23771 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA3P23771 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA3P23771 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA3P23771 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA3P23771 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA3P23771 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA3P23771 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA3P23771 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA3P23771 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA3P23771 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA3P23771 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA3P23771 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA3P23771 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA3P23771 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA3P23771 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA3P23771 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA3P23771 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA3P23771 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA3P23771 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA3P23771 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA3P23771 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA3P23771 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA3P23771 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA3P23771 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA3P23771 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA3P23771 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA3P23771 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA3P23771 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GATA3P23771 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA3P23771 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA3P23771 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GATA3P23771 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA3P23771 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA3P23771 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA3P23771 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATA3P23771 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA3P23771 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA3P23771 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA3P23771 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA3P23771 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATA3P23771 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA3P23771 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA3P23771 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA3P23771 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATA3P23771 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA3P23771 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA3P23771 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA3P23771 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA3P23771 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA3P23771 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA3P23771 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA3P23771 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA3P23771 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA3P23771 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA3P23771 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA3P23771 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA3P23771 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA3P23771 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA3P23771 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA3P23771 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA3P23771 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA3P23771 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA3P23771 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA3P23771 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA3P23771 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA3P23771 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA3P23771 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA3P23771 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA3P23771 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA3P23771 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA3P23771 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA3P23771 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA3P23771 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA3P23771 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA3P23771 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA3P23771 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA3P23771 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATA3P23771 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA3P23771 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATA3P23771 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA3P23771 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA3P23771 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA3P23771 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA3P23771 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATA3P23771 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA3P23771 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA3P23771 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA3P23771 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA3P23771 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA3P23771 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATA3P23771 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA3P23771 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA3P23771 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATA3P23771 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GATA3P23771 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATA3P23771 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA3P23771 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATA3P23771 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms