Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HmbsP22907 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HmbsP22907 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HmbsP22907 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmbsP22907 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmbsP22907 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HmbsP22907 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HmbsP22907 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HmbsP22907 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HmbsP22907 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmbsP22907 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HmbsP22907 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HmbsP22907 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HmbsP22907 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HmbsP22907 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HmbsP22907 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmbsP22907 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmbsP22907 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmbsP22907 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HmbsP22907 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmbsP22907 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmbsP22907 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmbsP22907 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmbsP22907 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms