Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKACBP22694 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKACBP22694 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRKACBP22694 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKACBP22694 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKACBP22694 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKACBP22694 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKACBP22694 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKACBP22694 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKACBP22694 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKACBP22694 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACBP22694 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACBP22694 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKACBP22694 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKACBP22694 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKACBP22694 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms