Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNOP22674 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNOP22674 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNOP22674 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNOP22674 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNOP22674 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNOP22674 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNOP22674 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNOP22674 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNOP22674 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNOP22674 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNOP22674 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNOP22674 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNOP22674 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNOP22674 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNOP22674 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNOP22674 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNOP22674 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNOP22674 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNOP22674 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNOP22674 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNOP22674 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNOP22674 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNOP22674 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNOP22674 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNOP22674 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNOP22674 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNOP22674 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNOP22674 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNOP22674 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNOP22674 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNOP22674 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNOP22674 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNOP22674 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNOP22674 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNOP22674 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNOP22674 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNOP22674 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNOP22674 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNOP22674 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNOP22674 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNOP22674 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNOP22674 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNOP22674 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNOP22674 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNOP22674 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNOP22674 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNOP22674 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNOP22674 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNOP22674 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNOP22674 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNOP22674 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNOP22674 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNOP22674 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNOP22674 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNOP22674 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNOP22674 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNOP22674 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNOP22674 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNOP22674 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNOP22674 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNOP22674 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNOP22674 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNOP22674 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNOP22674 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNOP22674 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNOP22674 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNOP22674 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNOP22674 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNOP22674 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNOP22674 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNOP22674 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNOP22674 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNOP22674 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNOP22674 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNOP22674 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNOP22674 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNOP22674 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNOP22674 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNOP22674 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNOP22674 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNOP22674 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNOP22674 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNOP22674 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNOP22674 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNOP22674 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNOP22674 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNOP22674 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNOP22674 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNOP22674 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNOP22674 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNOP22674 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNOP22674 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNOP22674 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNOP22674 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNOP22674 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNOP22674 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNOP22674 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNOP22674 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNOP22674 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms