Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNA5P22460 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNA5P22460 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNA5P22460 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNA5P22460 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNA5P22460 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNA5P22460 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNA5P22460 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNA5P22460 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNA5P22460 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNA5P22460 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNA5P22460 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNA5P22460 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNA5P22460 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNA5P22460 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNA5P22460 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNA5P22460 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNA5P22460 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNA5P22460 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNA5P22460 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms