Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FGFR4P22455 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGFR4P22455 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FGFR4P22455 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FGFR4P22455 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FGFR4P22455 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FGFR4P22455 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FGFR4P22455 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGFR4P22455 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms