Protein–RNA interactions for Protein: P22434

PDE1, 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDE1P22434 POM34YLR018C 900 nt10.29□□□□□ -0.76
PDE1P22434 TOM6YOR045W 186 nt10.28□□□□□ -0.76
PDE1P22434 SWE1YJL187C 2460 nt10.28□□□□□ -0.76
PDE1P22434 RIB3YDR487C 627 nt10.27□□□□□ -0.77
PDE1P22434 YML089CYML089C 369 nt10.27□□□□□ -0.77
PDE1P22434 YGR012WYGR012W 1182 nt10.26□□□□□ -0.77
PDE1P22434 LSC2YGR244C 1284 nt10.25□□□□□ -0.77
PDE1P22434 PEX2YJL210W 816 nt10.24□□□□□ -0.77
PDE1P22434 YLR349WYLR349W 507 nt10.24□□□□□ -0.77
PDE1P22434 STE4YOR212W 1272 nt10.23□□□□□ -0.77
PDE1P22434 NRT1YOR071C 1797 nt10.23□□□□□ -0.77
PDE1P22434 STR3YGL184C 1398 nt10.2□□□□□ -0.78
PDE1P22434 TIF6YPR016C 738 nt10.2□□□□□ -0.78
PDE1P22434 MET28YIR017C 564 nt10.19□□□□□ -0.78
PDE1P22434 YLR279WYLR279W 390 nt10.19□□□□□ -0.78
PDE1P22434 YNR029CYNR029C 1290 nt10.19□□□□□ -0.78
PDE1P22434 PRO1YDR300C 1287 nt10.18□□□□□ -0.78
PDE1P22434 FUN14YAL008W 597 nt10.18□□□□□ -0.78
PDE1P22434 RPM1RPM1 483 nt10.18□□□□□ -0.78
PDE1P22434 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.15□□□□□ -0.78
PDE1P22434 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.15□□□□□ -0.78
PDE1P22434 DUS1YML080W 1272 nt10.15□□□□□ -0.78
PDE1P22434 YJL195CYJL195C 702 nt10.13□□□□□ -0.79
PDE1P22434 AQY2YLL052C 450 nt10.13□□□□□ -0.79
PDE1P22434 ARP6YLR085C 1317 nt10.12□□□□□ -0.79
PDE1P22434 FIT3YOR383C 615 nt10.12□□□□□ -0.79
PDE1P22434 ATG15YCR068W 1563 nt10.12□□□□□ -0.79
PDE1P22434 MSB4YOL112W 1479 nt10.11□□□□□ -0.79
PDE1P22434 YCL074WYCL074W 927 nt10.11□□□□□ -0.79
PDE1P22434 ADH1YOL086C 1047 nt10.1□□□□□ -0.79
PDE1P22434 ADH7YCR105W 1086 nt10.07□□□□□ -0.8
PDE1P22434 YPI1YFR003C 468 nt10.07□□□□□ -0.8
PDE1P22434 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.07□□□□□ -0.8
PDE1P22434 PAC11YDR488C 1602 nt10.05□□□□□ -0.8
PDE1P22434 PAU15YIR041W 375 nt10.03□□□□□ -0.8
PDE1P22434 GAP1YKR039W 1809 nt10.03□□□□□ -0.8
PDE1P22434 GND1YHR183W 1470 nt10.01□□□□□ -0.81
PDE1P22434 YEL008WYEL008W 381 nt10□□□□□ -0.81
PDE1P22434 RTN2YDL204W 1182 nt9.99□□□□□ -0.81
PDE1P22434 LOT5YKL183W 921 nt9.98□□□□□ -0.81
PDE1P22434 CPD1YGR247W 720 nt9.93□□□□□ -0.82
PDE1P22434 YAR028WYAR028W 705 nt9.93□□□□□ -0.82
PDE1P22434 DIF1YLR437C 402 nt9.93□□□□□ -0.82
PDE1P22434 PLB1YMR008C 1995 nt9.93□□□□□ -0.82
PDE1P22434 ALP1YNL270C 1722 nt9.93□□□□□ -0.82
PDE1P22434 ESS1YJR017C 513 nt9.92□□□□□ -0.82
PDE1P22434 AAC1YMR056C 930 nt9.92□□□□□ -0.82
PDE1P22434 GPN2YOR262W 1044 nt9.91□□□□□ -0.82
PDE1P22434 ZTA1YBR046C 1005 nt9.9□□□□□ -0.82
PDE1P22434 FCY21YER060W 1587 nt9.88□□□□□ -0.83
PDE1P22434 MTG2YHR168W 1557 nt9.88□□□□□ -0.83
PDE1P22434 FUR4YBR021W 1902 nt9.88□□□□□ -0.83
PDE1P22434 APT2YDR441C 546 nt9.87□□□□□ -0.83
PDE1P22434 AKR2YOR034C 2250 nt9.86□□□□□ -0.83
PDE1P22434 SMM1YNR015W 1155 nt9.85□□□□□ -0.83
PDE1P22434 NVJ2YPR091C 2313 nt9.85□□□□□ -0.83
PDE1P22434 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.83□□□□□ -0.84
PDE1P22434 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.82□□□□□ -0.84
PDE1P22434 UTR1YJR049C 1593 nt9.81□□□□□ -0.84
PDE1P22434 HXT12YIL170W 1374 nt9.81□□□□□ -0.84
PDE1P22434 RIB2YOL066C 1776 nt9.78□□□□□ -0.84
PDE1P22434 NAP1YKR048C 1254 nt9.75□□□□□ -0.85
PDE1P22434 YGR259CYGR259C 441 nt9.74□□□□□ -0.85
PDE1P22434 PRY1YJL079C 900 nt9.74□□□□□ -0.85
PDE1P22434 YKR005CYKR005C 1578 nt9.73□□□□□ -0.85
PDE1P22434 SEN2YLR105C 1134 nt9.73□□□□□ -0.85
PDE1P22434 PUP1YOR157C 786 nt9.73□□□□□ -0.85
PDE1P22434 SED1YDR077W 1017 nt9.71□□□□□ -0.86
PDE1P22434 PGC1YPL206C 966 nt9.71□□□□□ -0.86
PDE1P22434 UGA4YDL210W 1716 nt9.7□□□□□ -0.86
PDE1P22434 YBR232CYBR232C 360 nt9.7□□□□□ -0.86
PDE1P22434 SAM35YHR083W 990 nt9.68□□□□□ -0.86
PDE1P22434 ALD4YOR374W 1560 nt9.67□□□□□ -0.86
PDE1P22434 VRG4YGL225W 1014 nt9.67□□□□□ -0.86
PDE1P22434 CCT5YJR064W 1689 nt9.65□□□□□ -0.86
PDE1P22434 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PDE1P22434 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PDE1P22434 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PDE1P22434 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PDE1P22434 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PDE1P22434 STP3YLR375W 1032 nt9.64□□□□□ -0.87
PDE1P22434 PAU5YFL020C 369 nt9.62□□□□□ -0.87
PDE1P22434 PRM5YIL117C 957 nt9.61□□□□□ -0.87
PDE1P22434 YJL055WYJL055W 738 nt9.61□□□□□ -0.87
PDE1P22434 LIP1YMR298W 453 nt9.61□□□□□ -0.87
PDE1P22434 PRP4YPR178W 1398 nt9.6□□□□□ -0.87
PDE1P22434 YPL251WYPL251W 303 nt9.59□□□□□ -0.87
PDE1P22434 DBP1YPL119C 1854 nt9.58□□□□□ -0.88
PDE1P22434 CSM1YCR086W 573 nt9.57□□□□□ -0.88
PDE1P22434 YJL064WYJL064W 396 nt9.56□□□□□ -0.88
PDE1P22434 LEU9YOR108W 1815 nt9.55□□□□□ -0.88
PDE1P22434 PAU19YMR325W 375 nt9.55□□□□□ -0.88
PDE1P22434 HSP60YLR259C 1719 nt9.55□□□□□ -0.88
PDE1P22434 YBL086CYBL086C 1401 nt9.55□□□□□ -0.88
PDE1P22434 DPS1YLL018C 1674 nt9.53□□□□□ -0.88
PDE1P22434 BMT6YLR063W 1098 nt9.53□□□□□ -0.88
PDE1P22434 GAL3YDR009W 1563 nt9.52□□□□□ -0.89
PDE1P22434 IRC24YIR036C 792 nt9.52□□□□□ -0.89
PDE1P22434 YJL118WYJL118W 660 nt9.51□□□□□ -0.89
PDE1P22434 BRR1YPR057W 1026 nt9.51□□□□□ -0.89
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