Protein–RNA interactions for Protein: P22303

ACHE, Acetylcholinesterase, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHEP22303 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACHEP22303 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACHEP22303 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACHEP22303 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACHEP22303 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACHEP22303 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACHEP22303 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACHEP22303 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACHEP22303 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACHEP22303 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACHEP22303 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACHEP22303 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACHEP22303 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACHEP22303 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACHEP22303 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACHEP22303 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACHEP22303 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACHEP22303 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACHEP22303 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACHEP22303 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACHEP22303 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACHEP22303 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACHEP22303 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACHEP22303 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACHEP22303 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACHEP22303 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACHEP22303 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACHEP22303 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACHEP22303 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACHEP22303 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACHEP22303 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACHEP22303 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACHEP22303 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACHEP22303 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACHEP22303 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACHEP22303 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACHEP22303 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACHEP22303 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACHEP22303 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACHEP22303 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACHEP22303 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACHEP22303 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACHEP22303 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACHEP22303 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACHEP22303 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACHEP22303 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACHEP22303 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACHEP22303 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACHEP22303 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACHEP22303 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACHEP22303 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACHEP22303 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACHEP22303 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACHEP22303 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACHEP22303 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACHEP22303 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACHEP22303 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACHEP22303 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACHEP22303 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACHEP22303 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACHEP22303 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACHEP22303 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACHEP22303 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACHEP22303 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACHEP22303 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACHEP22303 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACHEP22303 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACHEP22303 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACHEP22303 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACHEP22303 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACHEP22303 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACHEP22303 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACHEP22303 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACHEP22303 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACHEP22303 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACHEP22303 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACHEP22303 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACHEP22303 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACHEP22303 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACHEP22303 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACHEP22303 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACHEP22303 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACHEP22303 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACHEP22303 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACHEP22303 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACHEP22303 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACHEP22303 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACHEP22303 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACHEP22303 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACHEP22303 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACHEP22303 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACHEP22303 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACHEP22303 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACHEP22303 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACHEP22303 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACHEP22303 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACHEP22303 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACHEP22303 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACHEP22303 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACHEP22303 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms