Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SftpcP21841 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SftpcP21841 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SftpcP21841 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SftpcP21841 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SftpcP21841 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SftpcP21841 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpcP21841 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpcP21841 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpcP21841 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpcP21841 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpcP21841 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpcP21841 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpcP21841 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpcP21841 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpcP21841 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpcP21841 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpcP21841 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpcP21841 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpcP21841 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpcP21841 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpcP21841 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpcP21841 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpcP21841 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpcP21841 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpcP21841 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpcP21841 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpcP21841 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpcP21841 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SftpcP21841 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SftpcP21841 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SftpcP21841 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SftpcP21841 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SftpcP21841 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpcP21841 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SftpcP21841 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SftpcP21841 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpcP21841 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SftpcP21841 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpcP21841 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SftpcP21841 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SftpcP21841 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SftpcP21841 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SftpcP21841 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpcP21841 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpcP21841 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpcP21841 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SftpcP21841 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SftpcP21841 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SftpcP21841 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms