Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPD1P21695 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPD1P21695 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GPD1P21695 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPD1P21695 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPD1P21695 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPD1P21695 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPD1P21695 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPD1P21695 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPD1P21695 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPD1P21695 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPD1P21695 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPD1P21695 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPD1P21695 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GPD1P21695 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPD1P21695 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPD1P21695 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPD1P21695 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPD1P21695 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPD1P21695 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPD1P21695 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPD1P21695 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPD1P21695 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPD1P21695 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPD1P21695 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPD1P21695 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPD1P21695 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPD1P21695 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GPD1P21695 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPD1P21695 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPD1P21695 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPD1P21695 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPD1P21695 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPD1P21695 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPD1P21695 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPD1P21695 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPD1P21695 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPD1P21695 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPD1P21695 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GPD1P21695 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPD1P21695 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPD1P21695 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPD1P21695 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPD1P21695 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPD1P21695 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPD1P21695 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPD1P21695 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPD1P21695 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPD1P21695 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPD1P21695 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPD1P21695 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPD1P21695 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPD1P21695 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GPD1P21695 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPD1P21695 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPD1P21695 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPD1P21695 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPD1P21695 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPD1P21695 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPD1P21695 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPD1P21695 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPD1P21695 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPD1P21695 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPD1P21695 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPD1P21695 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPD1P21695 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPD1P21695 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPD1P21695 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPD1P21695 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPD1P21695 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPD1P21695 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPD1P21695 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPD1P21695 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPD1P21695 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPD1P21695 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPD1P21695 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GPD1P21695 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPD1P21695 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPD1P21695 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPD1P21695 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPD1P21695 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPD1P21695 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPD1P21695 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GPD1P21695 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPD1P21695 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPD1P21695 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPD1P21695 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPD1P21695 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPD1P21695 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GPD1P21695 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GPD1P21695 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPD1P21695 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPD1P21695 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPD1P21695 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPD1P21695 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPD1P21695 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPD1P21695 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPD1P21695 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPD1P21695 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPD1P21695 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms