Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KitlgP20826 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KitlgP20826 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KitlgP20826 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KitlgP20826 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KitlgP20826 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KitlgP20826 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KitlgP20826 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KitlgP20826 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KitlgP20826 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KitlgP20826 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KitlgP20826 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KitlgP20826 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KitlgP20826 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KitlgP20826 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KitlgP20826 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KitlgP20826 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
KitlgP20826 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KitlgP20826 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KitlgP20826 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KitlgP20826 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KitlgP20826 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KitlgP20826 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KitlgP20826 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms