Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN3P20807 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN3P20807 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN3P20807 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN3P20807 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN3P20807 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN3P20807 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN3P20807 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN3P20807 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN3P20807 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN3P20807 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CAPN3P20807 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN3P20807 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN3P20807 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms