Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NR1D1P20393 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NR1D1P20393 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1D1P20393 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR1D1P20393 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR1D1P20393 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1D1P20393 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1D1P20393 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1D1P20393 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1D1P20393 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR1D1P20393 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NR1D1P20393 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NR1D1P20393 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1D1P20393 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1D1P20393 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1D1P20393 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR1D1P20393 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NR1D1P20393 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR1D1P20393 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR1D1P20393 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR1D1P20393 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR1D1P20393 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NR1D1P20393 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR1D1P20393 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR1D1P20393 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR1D1P20393 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NR1D1P20393 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR1D1P20393 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms