Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMCHP20382 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMCHP20382 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMCHP20382 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMCHP20382 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHP20382 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHP20382 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHP20382 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHP20382 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHP20382 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHP20382 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMCHP20382 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMCHP20382 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMCHP20382 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHP20382 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHP20382 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHP20382 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHP20382 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHP20382 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHP20382 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHP20382 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PMCHP20382 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMCHP20382 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMCHP20382 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHP20382 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHP20382 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMCHP20382 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMCHP20382 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMCHP20382 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMCHP20382 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMCHP20382 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMCHP20382 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMCHP20382 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMCHP20382 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMCHP20382 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHP20382 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHP20382 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHP20382 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHP20382 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHP20382 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHP20382 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHP20382 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHP20382 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHP20382 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHP20382 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHP20382 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHP20382 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHP20382 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHP20382 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHP20382 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHP20382 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMCHP20382 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMCHP20382 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHP20382 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHP20382 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHP20382 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHP20382 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHP20382 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHP20382 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHP20382 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHP20382 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHP20382 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHP20382 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHP20382 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHP20382 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHP20382 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHP20382 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHP20382 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHP20382 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHP20382 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHP20382 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHP20382 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PMCHP20382 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMCHP20382 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMCHP20382 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PMCHP20382 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMCHP20382 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMCHP20382 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PMCHP20382 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMCHP20382 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMCHP20382 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMCHP20382 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMCHP20382 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMCHP20382 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMCHP20382 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMCHP20382 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PMCHP20382 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PMCHP20382 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PMCHP20382 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMCHP20382 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMCHP20382 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMCHP20382 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMCHP20382 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms