Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRM3P20309 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRM3P20309 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRM3P20309 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRM3P20309 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRM3P20309 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRM3P20309 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRM3P20309 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRM3P20309 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRM3P20309 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRM3P20309 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRM3P20309 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRM3P20309 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRM3P20309 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRM3P20309 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRM3P20309 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRM3P20309 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRM3P20309 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRM3P20309 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRM3P20309 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRM3P20309 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRM3P20309 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRM3P20309 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRM3P20309 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRM3P20309 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRM3P20309 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRM3P20309 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms