Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ms4a1P19437 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ms4a1P19437 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ms4a1P19437 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ms4a1P19437 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ms4a1P19437 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ms4a1P19437 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ms4a1P19437 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ms4a1P19437 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a1P19437 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ms4a1P19437 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ms4a1P19437 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ms4a1P19437 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ms4a1P19437 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ms4a1P19437 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ms4a1P19437 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ms4a1P19437 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a1P19437 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms