Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPL17P18621 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPL17P18621 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPL17P18621 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPL17P18621 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPL17P18621 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPL17P18621 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPL17P18621 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPL17P18621 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPL17P18621 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RPL17P18621 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RPL17P18621 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPL17P18621 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPL17P18621 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPL17P18621 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL17P18621 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL17P18621 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL17P18621 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL17P18621 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPL17P18621 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPL17P18621 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPL17P18621 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPL17P18621 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPL17P18621 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPL17P18621 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPL17P18621 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RPL17P18621 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPL17P18621 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPL17P18621 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPL17P18621 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPL17P18621 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPL17P18621 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPL17P18621 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPL17P18621 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPL17P18621 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPL17P18621 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL17P18621 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL17P18621 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL17P18621 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL17P18621 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL17P18621 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL17P18621 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL17P18621 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL17P18621 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL17P18621 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL17P18621 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL17P18621 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL17P18621 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPL17P18621 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPL17P18621 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPL17P18621 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPL17P18621 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPL17P18621 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPL17P18621 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPL17P18621 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL17P18621 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL17P18621 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL17P18621 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL17P18621 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPL17P18621 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPL17P18621 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPL17P18621 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPL17P18621 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPL17P18621 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPL17P18621 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPL17P18621 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPL17P18621 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPL17P18621 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPL17P18621 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPL17P18621 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPL17P18621 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPL17P18621 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL17P18621 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL17P18621 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL17P18621 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL17P18621 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL17P18621 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPL17P18621 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPL17P18621 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RPL17P18621 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPL17P18621 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPL17P18621 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPL17P18621 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPL17P18621 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPL17P18621 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPL17P18621 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPL17P18621 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPL17P18621 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPL17P18621 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPL17P18621 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPL17P18621 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPL17P18621 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPL17P18621 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPL17P18621 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPL17P18621 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPL17P18621 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPL17P18621 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPL17P18621 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPL17P18621 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPL17P18621 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms