Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P18526 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P18526 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18526 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18526 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18526 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18526 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18526 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18526 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
P18526 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18526 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18526 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P18526 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P18526 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P18526 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P18526 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P18526 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P18526 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P18526 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P18526 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18526 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18526 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18526 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P18526 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P18526 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P18526 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P18526 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P18526 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P18526 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P18526 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P18526 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P18526 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P18526 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P18526 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P18526 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P18526 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P18526 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P18526 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P18526 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P18526 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18526 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18526 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P18526 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P18526 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P18526 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P18526 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P18526 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P18526 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P18526 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18526 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18526 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18526 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P18526 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P18526 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P18526 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18526 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18526 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18526 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18526 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18526 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18526 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
P18526 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18526 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18526 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18526 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P18526 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P18526 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P18526 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18526 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P18526 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18526 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18526 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P18526 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18526 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18526 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18526 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P18526 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P18526 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18526 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18526 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18526 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18526 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18526 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18526 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18526 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P18526 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P18526 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P18526 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P18526 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P18526 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P18526 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P18526 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P18526 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P18526 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18526 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18526 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18526 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18526 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18526 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P18526 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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