Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKACAP17612 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKACAP17612 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKACAP17612 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKACAP17612 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKACAP17612 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKACAP17612 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKACAP17612 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKACAP17612 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACAP17612 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACAP17612 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACAP17612 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACAP17612 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKACAP17612 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACAP17612 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms