Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKMT2P17540 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKMT2P17540 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKMT2P17540 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CKMT2P17540 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CKMT2P17540 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKMT2P17540 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CKMT2P17540 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKMT2P17540 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKMT2P17540 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKMT2P17540 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKMT2P17540 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKMT2P17540 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms