Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTRB1P17538 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTRB1P17538 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTRB1P17538 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTRB1P17538 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTRB1P17538 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTRB1P17538 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms