Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfb3P17125 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfb3P17125 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb3P17125 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb3P17125 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb3P17125 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb3P17125 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfb3P17125 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tgfb3P17125 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb3P17125 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb3P17125 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb3P17125 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb3P17125 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tgfb3P17125 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tgfb3P17125 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfb3P17125 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tgfb3P17125 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tgfb3P17125 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tgfb3P17125 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tgfb3P17125 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tgfb3P17125 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tgfb3P17125 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tgfb3P17125 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tgfb3P17125 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tgfb3P17125 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tgfb3P17125 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tgfb3P17125 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb3P17125 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfb3P17125 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tgfb3P17125 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgfb3P17125 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms