Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF2P15336 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF2P15336 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF2P15336 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF2P15336 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF2P15336 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF2P15336 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF2P15336 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF2P15336 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF2P15336 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF2P15336 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF2P15336 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATF2P15336 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF2P15336 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF2P15336 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATF2P15336 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF2P15336 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATF2P15336 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATF2P15336 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF2P15336 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATF2P15336 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATF2P15336 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF2P15336 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATF2P15336 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ATF2P15336 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF2P15336 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF2P15336 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATF2P15336 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF2P15336 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF2P15336 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATF2P15336 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATF2P15336 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATF2P15336 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATF2P15336 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF2P15336 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF2P15336 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF2P15336 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF2P15336 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF2P15336 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATF2P15336 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF2P15336 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF2P15336 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF2P15336 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF2P15336 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF2P15336 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF2P15336 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF2P15336 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF2P15336 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF2P15336 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF2P15336 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF2P15336 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF2P15336 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF2P15336 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF2P15336 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF2P15336 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF2P15336 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF2P15336 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF2P15336 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF2P15336 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF2P15336 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF2P15336 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATF2P15336 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF2P15336 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF2P15336 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF2P15336 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF2P15336 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF2P15336 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF2P15336 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF2P15336 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF2P15336 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF2P15336 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF2P15336 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF2P15336 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF2P15336 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF2P15336 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF2P15336 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF2P15336 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF2P15336 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF2P15336 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF2P15336 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF2P15336 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF2P15336 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF2P15336 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF2P15336 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF2P15336 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF2P15336 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF2P15336 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF2P15336 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF2P15336 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF2P15336 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF2P15336 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF2P15336 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF2P15336 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF2P15336 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF2P15336 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF2P15336 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF2P15336 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF2P15336 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF2P15336 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF2P15336 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms