Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NID1P14543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NID1P14543 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NID1P14543 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID1P14543 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID1P14543 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NID1P14543 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NID1P14543 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NID1P14543 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NID1P14543 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NID1P14543 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NID1P14543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NID1P14543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NID1P14543 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NID1P14543 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NID1P14543 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NID1P14543 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NID1P14543 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID1P14543 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID1P14543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID1P14543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID1P14543 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID1P14543 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID1P14543 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID1P14543 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID1P14543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID1P14543 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID1P14543 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID1P14543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID1P14543 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID1P14543 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NID1P14543 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NID1P14543 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NID1P14543 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NID1P14543 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NID1P14543 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NID1P14543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NID1P14543 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NID1P14543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NID1P14543 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NID1P14543 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NID1P14543 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NID1P14543 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NID1P14543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NID1P14543 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NID1P14543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NID1P14543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NID1P14543 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID1P14543 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID1P14543 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID1P14543 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NID1P14543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NID1P14543 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NID1P14543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID1P14543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NID1P14543 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID1P14543 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID1P14543 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID1P14543 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NID1P14543 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID1P14543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NID1P14543 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID1P14543 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NID1P14543 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID1P14543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NID1P14543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID1P14543 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NID1P14543 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NID1P14543 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NID1P14543 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NID1P14543 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID1P14543 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NID1P14543 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID1P14543 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NID1P14543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NID1P14543 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NID1P14543 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID1P14543 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID1P14543 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID1P14543 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID1P14543 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NID1P14543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID1P14543 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NID1P14543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID1P14543 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NID1P14543 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID1P14543 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID1P14543 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NID1P14543 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NID1P14543 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID1P14543 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NID1P14543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID1P14543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID1P14543 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NID1P14543 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NID1P14543 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NID1P14543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID1P14543 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID1P14543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NID1P14543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms