Protein–RNA interactions for Protein: P13807

GYS1, Glycogen [starch] synthase, muscle, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS1P13807 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GYS1P13807 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GYS1P13807 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GYS1P13807 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GYS1P13807 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GYS1P13807 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GYS1P13807 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GYS1P13807 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GYS1P13807 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GYS1P13807 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GYS1P13807 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
GYS1P13807 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GYS1P13807 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GYS1P13807 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GYS1P13807 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GYS1P13807 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GYS1P13807 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GYS1P13807 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GYS1P13807 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GYS1P13807 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GYS1P13807 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GYS1P13807 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GYS1P13807 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GYS1P13807 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GYS1P13807 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GYS1P13807 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GYS1P13807 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GYS1P13807 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GYS1P13807 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GYS1P13807 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GYS1P13807 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GYS1P13807 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GYS1P13807 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GYS1P13807 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GYS1P13807 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GYS1P13807 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GYS1P13807 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
GYS1P13807 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GYS1P13807 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GYS1P13807 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GYS1P13807 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
GYS1P13807 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GYS1P13807 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GYS1P13807 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GYS1P13807 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GYS1P13807 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GYS1P13807 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GYS1P13807 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GYS1P13807 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GYS1P13807 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GYS1P13807 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GYS1P13807 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GYS1P13807 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GYS1P13807 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GYS1P13807 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GYS1P13807 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GYS1P13807 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GYS1P13807 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GYS1P13807 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GYS1P13807 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GYS1P13807 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GYS1P13807 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GYS1P13807 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GYS1P13807 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GYS1P13807 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GYS1P13807 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GYS1P13807 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GYS1P13807 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GYS1P13807 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GYS1P13807 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
GYS1P13807 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GYS1P13807 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
GYS1P13807 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GYS1P13807 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
GYS1P13807 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GYS1P13807 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GYS1P13807 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GYS1P13807 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GYS1P13807 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
GYS1P13807 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GYS1P13807 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GYS1P13807 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GYS1P13807 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GYS1P13807 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GYS1P13807 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GYS1P13807 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GYS1P13807 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GYS1P13807 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GYS1P13807 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GYS1P13807 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GYS1P13807 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
GYS1P13807 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GYS1P13807 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GYS1P13807 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GYS1P13807 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GYS1P13807 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GYS1P13807 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GYS1P13807 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GYS1P13807 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
GYS1P13807 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms