Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
MS4A1P11836 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
MS4A1P11836 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MS4A1P11836 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MS4A1P11836 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MS4A1P11836 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MS4A1P11836 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MS4A1P11836 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MS4A1P11836 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MS4A1P11836 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MS4A1P11836 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MS4A1P11836 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MS4A1P11836 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MS4A1P11836 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MS4A1P11836 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MS4A1P11836 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
MS4A1P11836 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MS4A1P11836 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MS4A1P11836 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MS4A1P11836 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MS4A1P11836 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MS4A1P11836 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms