Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK4P11802 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK4P11802 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK4P11802 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK4P11802 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK4P11802 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK4P11802 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK4P11802 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK4P11802 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK4P11802 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK4P11802 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK4P11802 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK4P11802 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK4P11802 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK4P11802 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK4P11802 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK4P11802 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK4P11802 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK4P11802 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK4P11802 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK4P11802 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK4P11802 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK4P11802 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK4P11802 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK4P11802 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK4P11802 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK4P11802 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK4P11802 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK4P11802 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK4P11802 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK4P11802 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK4P11802 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK4P11802 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK4P11802 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK4P11802 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK4P11802 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK4P11802 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK4P11802 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK4P11802 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK4P11802 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK4P11802 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK4P11802 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK4P11802 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK4P11802 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK4P11802 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK4P11802 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK4P11802 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK4P11802 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK4P11802 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK4P11802 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK4P11802 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK4P11802 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK4P11802 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK4P11802 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK4P11802 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK4P11802 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK4P11802 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK4P11802 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK4P11802 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK4P11802 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK4P11802 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK4P11802 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK4P11802 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK4P11802 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK4P11802 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK4P11802 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK4P11802 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK4P11802 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK4P11802 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK4P11802 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK4P11802 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK4P11802 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK4P11802 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK4P11802 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK4P11802 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK4P11802 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK4P11802 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK4P11802 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK4P11802 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK4P11802 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK4P11802 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK4P11802 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK4P11802 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK4P11802 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK4P11802 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK4P11802 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK4P11802 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK4P11802 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK4P11802 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK4P11802 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK4P11802 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK4P11802 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK4P11802 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK4P11802 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK4P11802 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK4P11802 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK4P11802 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK4P11802 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK4P11802 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK4P11802 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms