Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP10400 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP10400 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP10400 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP10400 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP10400 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP10400 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP10400 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP10400 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP10400 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP10400 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP10400 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP10400 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP10400 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP10400 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP10400 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP10400 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP10400 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP10400 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP10400 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP10400 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP10400 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP10400 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP10400 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolP10400 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP10400 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP10400 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolP10400 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP10400 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP10400 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP10400 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP10400 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolP10400 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PolP10400 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PolP10400 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP10400 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP10400 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP10400 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PolP10400 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PolP10400 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PolP10400 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PolP10400 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PolP10400 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PolP10400 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PolP10400 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PolP10400 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PolP10400 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PolP10400 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP10400 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP10400 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP10400 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP10400 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP10400 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP10400 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP10400 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP10400 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP10400 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP10400 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP10400 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP10400 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP10400 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PolP10400 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PolP10400 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PolP10400 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PolP10400 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PolP10400 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PolP10400 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PolP10400 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PolP10400 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PolP10400 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PolP10400 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PolP10400 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PolP10400 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PolP10400 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PolP10400 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PolP10400 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PolP10400 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PolP10400 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PolP10400 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PolP10400 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PolP10400 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PolP10400 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PolP10400 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PolP10400 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PolP10400 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PolP10400 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PolP10400 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PolP10400 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PolP10400 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PolP10400 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PolP10400 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PolP10400 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PolP10400 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PolP10400 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PolP10400 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PolP10400 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PolP10400 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PolP10400 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PolP10400 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP10400 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms