Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccl2P10148 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl2P10148 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl2P10148 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl2P10148 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccl2P10148 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl2P10148 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl2P10148 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl2P10148 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl2P10148 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl2P10148 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl2P10148 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl2P10148 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl2P10148 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms